環氧乙烷具有良好的擴散和滲透能力。它可以穿透玻璃紙，黃色紙板（馬糞紙），聚氯乙烯薄膜，皮革以及油和水的薄層，因此可以進行消毒。物品可以不帶包裝。

環氧乙烷滅菌器中的氣體不損害滅菌的物品，且穿透力很強，可以將醫療器械上的病菌消滅干凈。環氧乙烷滅菌器適合于包裝材料用紙，不能用于環氧乙烷滅菌的包裝有金屬箱、復合透析紙、聚氯乙烯、玻璃紙、尼龍、決析器和一次性作用的診療用品。

環氧乙烷滅菌器屬于通氣型硬質容器，應放在通風良好的地方，切勿將它置于接近火源的地方。為方便維修及定期保養，環氧乙烷滅菌器各側(包括上方)應預留51cm空間。

當我們在使用滅菌器時，需要注意一些事項，這些事項都有，安裝或放空熱水器內的水后應注意，必須先將熱水器注滿水后，才能接通電源開機使用;每次使用前須更換滅菌劑藥盒下的過濾棉;當儲水溫度達到61℃以上時方可開機;滅菌過程進行中不得開箱蓋。關蓋失敗時，再次按開蓋鍵，重新關蓋;滅菌劑在使用前檢查是否結成塊，須搖動藥盒使藥分離成粉狀后使用;無防水裝置的內鏡器械不能采用本設備進行滅菌;所有內鏡管腔必須清洗干凈，可拆卸的零件均須拆開后滅菌，帶開關的器械打至“打開”位置;滅菌盤內器械排放自然，整齊，連接膠管和器械軟管不得有折疊、扭曲等現象;滅菌時軟管按盤內圓弧形放置，不得隨意扭曲。