RNase R（Ribonuclease R）是一種來源于大腸桿菌RNR超家族的3’-5’核糖核酸外切酶，可從3’-5’方向將RNA逐步切割成二核苷酸和三核苷酸。RNase R可消化幾乎所有的線性RNA分子，但不易消化環形RNA、套索結構或3’突出末端少于7個核苷酸的雙鏈RNA分子。

RNase R是circRNA的富集和鑒定實驗必備工具酶，可消化線性RNA以使環形RNA(circRNAs)或套索結構RNA(lariat RNA)得到富集。

RNase R消化RNA示意圖

應用場景

circRNA的富集：高通量測序是大批量發現circRNA最快捷的方法，需要對circRNA進行富集，此時RNase R消化就是必須的。

circRNA的鑒定：根據RNase R(+)和RNase R(-)組中是否檢測到條帶來證明檢測的分子是circRNA。

產品特征

特異性：特異性消化線性RNA

高效、快速：5-15min即可消化大部分線性RNA

buffer兼容性：消化產物可直接用于下游逆轉錄

使用方便：2種試劑，1步反應

產品信息

標準反應體系下，于 37℃，10 min 將 1 μg poly(A)轉化成酸溶核苷酸所需的酶量定義為一個活力單位(U)。

產品組分

反應體系

        20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 100 mM KCl, 0.1 mM MgCl2, 37℃孵育。

        注：1）RNase R 在 0.1-0.5 mM Mg2+存在時活性高，反應中 EDTA 可能降低 RNase R 活性，此時可額外添加 MgCl2 使 Mg2+ 濃度最高達到 0.5 mM。2）孵育后可于 70℃，10 min 使酶失活，再進行下游實驗（如逆轉錄）；也可不滅活，直接純化后進行下游實驗。

質量控制

        SDS-PAGE 檢測純度>99%；Total RNA 經 RNase R 消化后進行 RT-qPCR 檢測，線性 RNA 豐度明顯降低， 環形RNA 豐度基本不變。

性能比較：RNA電泳檢測

將10U RNase R加入到2.5 μg total RNA中，于37℃孵育30 min，之后直接進行電泳檢測，結果顯示RNase R+組28/18/5S條帶變淡（不可見），表明RNase R對total RNA的消化作用。吉賽和公司e或公司a的RNase R對total RNA消化效果相當。

性能比較：qRT-PCR檢測

將10U RNase R加入到2.5 μg total RNA中，于37℃孵育30 min，之后進行RT-qPCR實驗，結果顯示RNase R+ 組中hsa_circFOXO3_002和hsa_circMTO1_001的豐度基本不變，表明環形RNA耐受RNase R的消化。吉賽和公司e或公司a的RNase R效果相當。

注：數據計算以“RNase R+吉賽”組為對照，設定其相對豐度值為1。