從源頭防疫|食品組學提升應對健康風險和未來挑戰的認知
科學家和醫務工作者們日以繼日的奮戰,新型高致病性冠狀病毒(COVID-19)攻堅戰將迎來曙光。與此同時,科學家們也在加強人類健康和食品安全預警監測技術探索,以提升應對健康風險和未來挑戰的認知,預防“病從口入”。基于高分辨Orbitrap技術的蛋白質組學在不同物種肉類鑒別中的應用,幫助從源頭保障食品安全,預防食源性疾病發生。
2月7日,國際ding級學術期刊《柳葉刀》刊登了評論文章《Game consumption and the 2019 novel coronavirus》(野味消費與2019-nCoV)。評論認為,要避免民間因“食藥同源”哲學癡迷吃野生動物而導致自然界中病毒感染人類,需要人們改變以往飲食安全觀念。至此,進一步印證新型冠狀病毒肺炎是“病從口入”而引發的疫病。
根據美國科普作家大衛·夸蒙估計,約60%新發和突發傳染病,均為動物源性的病毒性傳染病。人畜共患病,如SARS、禽流感以及裂谷熱等疫病來源于動物,并經由人際傳播而爆發。動物發生的非人畜共患病,如豬瘟、豬圓環病毒病、藍耳病等,雖不直接傳染給人類,但其繼發感染產生的有害物質也可以使人類引起食物中毒。大量被人畜共患病病原或非人畜共患病病原污染的動物源性食品,將直接或間接對人類健康造成危害。
圖1.病毒從動物到人類的傳播
然而,近年潛藏風險的食品安全問題卻日趨嚴重:貪吃“野味”,“僵尸肉”,“瘦肉精”,不法商販更以狐貍、水貂、老鼠等未經檢驗檢疫的動物肉制品制售假羊肉或網紅食品“烤香腸”,等等。防控疫情,要溯源疫情源頭,極ng準防控。預防疫病,更要從源頭把控,防止食源性疾病發生。
面對新發疫病的威脅
如何做到盡早發現?
基于蛋白組的食品組學為不同物種肉類鑒別提供新的思路,能夠對物種特異性生物標志物進行鑒定和定量,為確證物種的真實性、來源和含量提供有力技術平臺,幫助提升應對健康風險和未來挑戰的認知,從源頭預防疫病。
不同物種肉類鑒別分析策略
蛋白組學技術應用于肉類品種鑒別,主要策略為:通過Orbitrap高分辨質譜平臺鑒定蛋白質肽段,并將鑒定結果與數據庫進行比對,篩選出不同物種特征性專屬多肽。建立上述專屬多肽的質譜定性、定量分析方法,從而實現對肉類品種的鑒別。
圖2.靶向蛋白質組學方法用于不同物種肉類鑒別分析策略
生物信息學分析
通過靶向肽質量指紋分析(PMF)牛、馬、羊、豬的肌紅蛋白,肌球蛋白和血紅蛋白的蛋白質特征性肽。基于這些初步結果,利用生物信息學對四種哺乳動物的肌紅蛋白,肌球蛋白和血紅蛋白進行完整的序列分析,找到特異性蛋白質肽段,比如肌紅蛋白(MG)特異性蛋白質肽段位于氨基酸位置120和134之間。以這些特征性肽段作為母離子,MS2質譜分析特征性肽段的母離子/子離子信息。
圖3.靶向哺乳動物肌肉蛋白的生物信息學分析
高分辨質譜分析
由于Orbitrap技術超高分辨率和超高質量精度,可對復雜蛋白質組樣品的進行更全面的表征和更深入的探索。本實驗中Orbitrap質譜儀分別在MS1 140K 和MS2 17.5K(FWHM)(m/z 200) 質量分辨率條件下分析,靶向肌紅蛋白蛋白質特征性肽的質量精度為-0.67至1.34 ppm。經過計算機模擬,肌紅蛋白蛋白質特征性肽具有很高的豐度。
圖4.不同物種肉分析的TIC和XIC圖
圖5.肌紅蛋白蛋白質特征性肽子離子圖(120–134)
肉摻假實驗
以1%(w/w)摻假水平將生豬肉添加到生牛肉,羊肉和雞肉中,通過實驗比較PRM和DIA兩種策略,結果表明兩種策略都滿足不同物種肉類摻假鑒別分析,而DIA可實現對所有母離子的檢測,與PRM相比,DIA數據采集不受指定目標肽段的限制,可用于未知蛋白和大規模蛋白進一步的數據挖掘。
圖6.肌紅蛋白蛋白質特征性肽XIC圖(加入1%豬肉,藍色空白對照)
除肌紅蛋白外,靶向肌肉蛋白的計算機模擬序列分析還找到了myosin-1,myosin-2和β-血紅蛋白特征性肽生物標記物,分別是肌球蛋白1619–638,肌球蛋白2619–639和β-血紅蛋白肽40–58。計算機模擬生成b和y離子MS2 Venn圖,清晰地顯示可以用于區分物種的特征母離子/子離子對信息。
圖7. 靶向肌肉蛋白計算機模擬序列分析鑒定出來自肌紅蛋白,myosin-1,myosin-2和β-血紅蛋白的蛋白質特征性肽。黑色表示序列一致性≥60%;紅色和綠色表示用于區分不同物種的特征氨基酸。
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