許國旺課題組提出非靶向代謝組數據處理和代謝物鑒定新方法
近日，許國旺課題組在非靶向代謝組學數據處理和代謝物鑒定中取得新進展，構建了系統性的液相色譜-質譜聯用的代謝物數據庫，通過保留時間校正，靶向提取，自動峰識別，二級質譜相似性計算等步驟，完成從原始數據到代謝物定性的數據處理流程，為代謝物的大規模鑒定提供了幫助。
非靶向代謝組學數據處理和代謝物鑒定是一個被廣泛關注的問題，數據處理質量和代謝物鑒定的準確性和覆蓋度直接影響后續分析和利用。經典的非靶向代謝組學數據處理流程常常基于一些峰匹配軟件（XCMS，MS-DIAL，MZmine2）獲得峰表，然后搜索數據庫進行代謝物的鑒定。由于目前常用數據庫中保留時間信息很少，并且在峰匹配過程中會丟失一些代謝物的信息，使得代謝物鑒定的準確性和覆蓋度亟需改進。
針對上述問題，許國旺課題組構建了一個包含保留時間，一級質譜，二級質譜信息的代謝物數據庫MetExDB，開發了基于此數據庫的非靶向代謝組學數據的代謝物靶向提取和鑒定的軟件MetEx。MetEx整合了保留時間校正、代謝物靶向提取、自動峰識別、二級質譜相似性計算等模塊，實現了從原始數據出發的自動化、高覆蓋的代謝物規模化鑒定。將數據庫和軟件用于人類血漿、尿液、HepG2細胞、小鼠肝臟和糞便樣本，可鑒定出900~ 1800種的代謝物。
相關研究成果以“MetEx:a Targeted Extraction Strategy for Improving the Coverage andAccuracy of Metabolite Annotation in Liquid Chromatography-HighResolution Mass Spectrometry Data”為題，發表在《分析化學》（AnalyticalChemistry）上。該工作的第 一作者是課題組博士研究生鄭福建，通訊作者為趙欣捷副研究員和許國旺研究員。上述工作得到了國家重 點研發計劃、國家自然科學基金、大連化物所創新基金等項目的資助。
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https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.analchem.1c04783（點擊閱讀原文查看）
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